Bei den meisten kunststofftüren ist das aber wohl nicht möglich die glasteile auszutauschen, die sind meist so verklebt dass immer eine neue Türe notwendig ist bei beschädigungen.

Also ich hab ne relativ neue Kunststofftür hier und es war absolut problemlos möglich, die Glasscheibe auszutauschen. Wir haben dann eine kürzere Glasscheibe eingesetzt und unten ein Stück - öhm - Kunststoff, wie er wohl auch sonst bei Haustüren verwendet wird in Kombination mit Glas (wenn ich das richtig verstanden habe

). Die Alternative wäre eine teurere Scheibe mit Ausschnitt für die Katzenklappe gewesen.
Lass Dir einfach mal verschiedene Angebote machen - für ne kleine Scheibe mit Loch und alternativ einen Einsatz aus Kunststoff.
Von der Isolierung her wird es keinen Unterschied machen - die meiste Kälte kommt es an der Klappe rein.